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Claude解开40年细胞之谜:首个细菌vault颗粒3D结构出炉

Claude解开40年细胞之谜:首个细菌vault颗粒3D结构出炉

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11月4日,Anthropic生物学研究团队公布了一项由Claude全程参与的研究:首次解析出原核细胞中vault颗粒的3D结构。这种中空蛋白桶1986年就被发现,功能至今成谜,而这次的新结构来自感染细菌的噬菌体蛋白L05,由96个相同的蛋白拷贝拼成。

从150亿条序列里捞出一个桶

团队先用Claude Science在约150亿条预测蛋白序列里筛查远亲,在29个细菌门和4个古菌门中找到踪迹;44个候选蛋白进入无细胞表达测试,24个转入大肠杆菌,其中15个产出可溶蛋白、7个自组装成桶状颗粒,冷冻电镜最终确认了4个。L05颗粒长约54纳米、宽45纳米,总质量约9.5兆道尔顿,比人类vault多包约25%的体积。Claude还把提纯从常规的三天压缩到约90分钟,第一个结构模型34小时就出来了,按常规流程可能要几周。这不是Claude第一次在蛋白质上动手,此前它用64小时自主设计蝎毒蛋白,211个候选中17个得到实验室确认。

AI也会开错药方

这篇的诚实之处在于,Anthropic没有只报喜。Claude写的一份培养基配方里多了一种会干扰DNA导入的添加剂,让项目拖后两周;冷冻电镜处理早期又跳过标准步骤,拼出一张左右颠倒的镜像图。团队的结论是:熟悉的环节能很快抓住模型错误,不熟的环节要付出时间代价。

眼下结论仍有限制:颗粒只在实验室大肠杆菌里做出,是否在天然宿主中同样形成还没验证;研究以预印本形式提交给bioRxiv,尚未经过同行评审。Anthropic介绍,整个项目不到四个月就走完了从筛查到解析的全程,多数步骤普通实验室用现有Claude产品就能复现,只有冷冻电镜分析动用了数百块GPU并行,超出一般学术机构的配置。下一步是弄清vault到底在细胞里做什么,以及能否把它改造成递送酶的纳米胶囊。

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